《南京工业大学学报（自然科学版）》（双月刊）创刊于1979年，是由南京工业大学主办的学术刊物。 《南京工业大学学报（自然科学版）》本刊编委由国内一流化工、材料、生工、化机、土木等方面专家组成，他们不但积极为本刊撰稿、审稿，还积极向同行专家约稿、组稿，从而得证了本刊的学术水平。本刊被英国CA，剑桥文摘，俄罗斯文摘，中国化学化工文摘，中国生物学文摘，中国无机分析化学文摘等收录，德国汉诺威大学图书馆，我国国家图书馆以及有关高校、研究所大型企业均订购我学报。获奖情况：中国期刊方阵双效期刊；中国高校优秀科技期刊奖；江苏省优秀期刊；中国高校科技期刊研究会优秀网站；1995年获全国高校自然科学优秀学报一等奖；曾两届荣获江苏省十佳期刊。
《南京工业大学学报》（社会科学版）（季刊）创刊于2002年，是由南京工业大学主办的社科类学术刊物。 《南京工业大学学报》（社会科学版）本刊坚持为社会主义现代化建设服务的方向和“双百”方针，大力扶持新人新作，本刊对哲学、政治学、经济学、法学、社会学、管理学以及文学、史学等学科进行理论探讨。本刊坚持理论与实践的统一，坚持时代性与科学性的统一，坚持学术性与可读性的统一。本刊为校内外优秀科研成果提供发表园地。获奖情况：全国高校优秀社科期刊、全国百优社科期刊、全国理工农医优秀编辑团队。